福建省疾病预防控制中心前身是成立于1953年的原福建省卫生防疫站，2003年7月由原福建省卫生防疫站、原福建省结核病防治所、原福建省健康教育所和原福建省皮肤病防治院性病、麻风病防治部门合并组建，同时加挂“福建省健康教育促进中心”、“福建省卫生检验检测中心”和“国家食品安全风险监测福建中心”三面牌子，是福建省卫生计生委直属副厅级公益一类事业单位。总部位于福州市鼓楼区津泰路，健康教育所位于鼓楼区华林路，医学实验动物科位于晋安区鼓山镇，第二门诊部位于仓山区则徐大道，总占地面积约48亩，建筑面积约3.2万平方米。

 

　　中心的主要职责是：疾病预防与控制；突发公共卫生事件应急处置；疫情报告及健康相关因素信息管理；健康危害因素监测与干预；实验室检测检验与评价；健康教育与健康促进；技术指导与应用研究。

 

　　中心内设11个处（所），下设34个科室，其中职能科室10个、业务科室24个。为发挥专业优势，中心开设预防接种和结核病治疗两个门诊部。编制425人，其中专业技术人员占89%；高级职称占30%，中级职称占33%；博士11人，硕士84人，在职享受国务院政府特殊津贴3人，国家卫生计生委有突出贡献中青年专家2人，福建省“百千万人才工程”的学科带头人和福建省卫生系统跨世纪学术和技术带头人18人，1人获全国优秀科技工作者、1人获福建省优秀科技工作者称号。人兽共患病研究重点实验室被福建省委授予“人才高地”称号。

 

　　中心实验室能力建设得到不断加强，新建了卫生检测大楼，改造装修了旧实验大楼，实验室总面积超过1.4万平方米。中心于1996年正式通过计量认证。2005年11月，正式通过中国实验室国家认可委的资格认证。2006年，又在全国省级疾控机构率先通过国家卫生计生委和国家认可委对BSL-3实验室的认证。近年来中心更新、增添了许多实验室精密检测设备，拥有高精尖先进仪器设备2600多台件，总值约1.25亿元，具备食品相关产品、涉水产品、消杀产品、公共场所监测和防病检测等15大类900多项的检测能力，基本达到国家卫生计生委、国家发改委规定的省级疾控机构检测能力要求。中心设有国家卫生计生委定点的艾滋病确认中心实验室、保健食品功能学评价实验室、脊髓灰质炎监测实验室、化妆品卫生安全性检测实验室和农业部认定的卫生杀虫剂毒理学试验实验室，是商务部2004年首批确定的食品安全定点检测机构，有省科技厅批准的人兽共患病研究重点实验室。是福建医科大学的教学基地，博士、硕士研究生教学点，是福建省公共卫生执业医师考试基地。