福建省食品药品质量检验研究院是完全独立的第三方药品检验机构，目前行政上隶属于福建省食品药品监督管理局，经济上独立核算，是经登记注册的事业法人单位，能独立承担法律责任。本院下设4个行政管理科室（办公室、人事教育科、财务科、设备科），3个业务管理科室（业务管理科、质量管理科、食品药品技术监督科），8个检验所（中药天然药物检验所、化学药品检验所、抗生素药品检验所、化妆品保健食品检验所、微生物检验所、药理毒理生物制品检验所、食品检验监测所、标准研究所）和2个辅助检验科室（实验动物资源研究所、后勤服务科）。

 

　　全院共有职工145人，其中高中级技术人员占专业技术人员总数的42%。本院现有仪器设备2723台（套），总值达9341万元，实验室面积 10888平方米。可对中药材、中成药、化学药及生化药、抗生素、医疗器械和食品药品包装材料与容器生物性能、食品、保健食品、化妆品、进口药品等进行检验。