安徽省医学科学研究院的前身为安徽省医学科学研究所，成立于1959年，隶属于安徽省卫生计生委直接领导，正处级，全额拨款事业单位，独立法人，是集医学科研、教学、科技服务等功能为一体的省级公益性综合医学科研机构。

 

　　2007年11月28日，经省编委批准更名为安徽省医学科学研究院；2008年1月29日经省卫生厅批准医科院内设5个专业医学研究所（中药研究所、药理毒理研究所、微生物研究所、预防医学研究所、临床医学研究所）和2个科技服务中心（安徽省实验动物质量监督检测中心、医药卫生检验检测中心）。

 

　　坐落于合肥市庐阳区永红路15号，实验大楼面积4090.88 m2。主要工作任务是承担全省基础医学和应用医学等学科领域的研究工作，同时积极推进科研成果产业化，对外提供有效地科技服务。